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病原微生物學的理論前沿已經從“一個病原導致一種疾病”的傳統(tǒng)模式邁向“特定的菌群結構與功能影響和決定個體發(fā)育和疾病發(fā)生發(fā)展” 的“后巴斯德時代”。腸道菌群和腸道微生態(tài)如何調節(jié)免疫功能和相關疾病，是目前生物學與醫(yī)學交叉研究的最前沿。當前面臨的重大挑戰(zhàn)是理解共生的生物學基礎，及共生菌對發(fā)育，生理，健康和疾病的影響。

中科院上海巴斯德所微生物、發(fā)育與健康研究中心有先進的多組學，培養(yǎng)組學，微流控和成像技術平臺以支持研究需求，擬挖掘腸道微生態(tài)與免疫調節(jié)的決定性因子，從而開辟多種重大疾病的干預策略。

有關本中心的更多信息，請訪問：www.ips.ac.cn/CMDH

CMDH現(xiàn)正積極招聘副研究員，分屬5個不同的研究組:

1) Jean-Marc COLLARD研究員領導的實驗細菌研究組

該課題組的目標是解讀人類新生兒期和出生后1000天內腸道微生物群的建立和變化，以更好地了解腸道微生物群逐步建立的制約因素、環(huán)境因素的影響和動態(tài)變化。解決微生物菌群的失調和疾病狀態(tài)。為了實現(xiàn)這些目標，擬采用宏分類學、單細胞分析和培養(yǎng)學相結合的方法，深入探究細菌群落的構建和由此產生的原核生物-原核生物共生。該課題組將與其他課題組緊密合作，特別是開發(fā)微流控、器官芯片技術、無菌動物和組學相關的課題組。

申請人應與中國科學院上海巴斯德研究所微生物、發(fā)育與健康研究中心（CMDH）的其他課題組密切交流（基因組學和蛋白質組學）。同時，根據(jù)申請人的資歷情況（畢業(yè)年限，職稱等），給予不同的崗位/待遇。

任職條件：

-在細菌學/營養(yǎng)學方面發(fā)表過文章，證實了其經驗 (厭氧菌學更佳) 。

-任職者應精通：

從不同生物基質中分離和培養(yǎng)細菌。

鑒定細菌(生化特性、16S rDNA測序、MALDI-TOF質譜)

分子生物學（即qPCR、克?。?。

著手對新發(fā)現(xiàn)的細菌進行（比較）基因組分析。

具有良好的職業(yè)道德、人格和品德。

具有良好的中英文溝通能力。

聯(lián)系方式: 研究員、課題組長:jean-marc.collard@ips.ac.cn/ 實驗室助理:lzhao@ips.ac.cn

2) Daniel FALUSH研究員領導的病原菌定量基因組學研究組

病原菌定量基因組欲招聘一名副研究員，其主要職責是與晁彥杰領導的RNA系統(tǒng)生物學組進行合作，共同研究自然細菌種群中發(fā)現(xiàn)的基因變異功能。

該組對包括副溶血弧菌和幽門螺桿菌在內的細菌種群進行了大規(guī)模的基因組變異調查，并發(fā)現(xiàn)了對特定菌株適應其利基有重大貢獻的基因組。受聘的副研究員將管理一個小型研究小組，負責在濕實驗室中描述細菌表型和轉錄組圖譜。

任職條件：

需要一位在細菌學方面經驗豐富的高級研究人員，并對基因組學、進化和微生物學之間的交叉領域感興趣。

聯(lián)系方式：研究員、課題組長：daniel.falush@ips.ac.cn/ 實驗室助理：bgu@ips.ac.cn

3) Parag KUNDU研究員領導的腸道菌群與宿主相互作用研究組

該研究組致力于了解腸道菌群和宿主干細胞之間的相互作用，主要目標之一是闡明腸道菌群的功能，研究機體在生長發(fā)育不同階段，穩(wěn)態(tài)和失調狀態(tài)下，腸道菌群與腸道/神經干細胞錯綜復雜的相互作用。

現(xiàn)該研究組誠聘腸道菌群和宿主健康領域全職副研究員。希望應聘者能夠使用系統(tǒng)生物學方法來解讀微生物、干細胞和宿主健康之間的關系，了解多種技術，如轉基因、無菌小鼠的菌群移植，掌握神經球和小腸類器官等體外平臺的構建。我們鼓勵以假設為驅動的跨學科交流，包括動物模型、組學和細胞信號傳導等研究。

任職條件：

-申請人應具有細胞生物學或微生物學/腸道菌群研究方向的博士學位，并具有廣泛的技術專長。

-具備干細胞生物學、神經生物學、宿主微生物相互作用和高通量測序技術等方面的知識。

-有腸道類器官或神經球培養(yǎng)經驗者優(yōu)先。

-申請人應具有高度的積極性，熟悉中國的基金申請系統(tǒng)，能夠獨立申請基金。

聯(lián)系方式： 研究員、課題組長：parag.kundu@ips.ac.cn/ 實驗室助理：slxing@ips.ac.cn

4) Richard LO-MAN研究員領導的免疫和小兒傳染病研究組

該研究組誠招一位有經驗的生物信息學家/計算生物學家加入我們的課題組，擔任副研究員。該組工作重點是結合免疫學及系統(tǒng)生物學方法來揭示小兒疾病中微生物群和免疫系統(tǒng)的關系。申請人需負責實驗室數(shù)據(jù)分析，主要職責包括管理并分析大型數(shù)據(jù)集以及開發(fā)新穎的分析方法；獨立開展課題。

主要職責：

-開發(fā)并運行計算策略，用于詮釋通過單細胞及長讀測序技術獲得的DNA/RNA數(shù)據(jù)，包括開發(fā)統(tǒng)計分析，設計和實施有效的分析渠道；

-管理、培訓工作人員和學生使用計算生物學工具。

任職條件：

-計算生物學、統(tǒng)計生物學、生物物理學、生物信息學或相關領域的博士。

-熟練使用R和/或Python進行編程；

-具有數(shù)據(jù)挖掘經驗，如參數(shù)和非參數(shù)統(tǒng)計方法、維度降低方法、多變量分析、貝葉斯統(tǒng)計或分類方法。

聯(lián)系方式： 研究員、課題組長：richard.loman@ips.ac.cn

5)Nicolas Berthet研究員領導的病原發(fā)現(xiàn)及其分子特征研究組

病原發(fā)現(xiàn)及其分子特征研究組是一個年輕并且充滿活力的研究組，主要研究方向為病原微生物方面以及在分子水平上對這些病原微生物進行鑒定，特別是病毒。研究組利用多種二代及三代高通量測序技術研究與發(fā)現(xiàn)新病原微生物，尤其是宿主為動物的病原體，深入鑒定整合入其宿主基因組的病毒基因組以及腸道宏病毒組，特別是噬菌體組。

因科研事業(yè)發(fā)展需要，病原發(fā)現(xiàn)及其分子特征研究組現(xiàn)向國內外公開招聘應用微生物學領域副研究員一名。該崗位職責為展開不同研究項目，研究噬菌體如何影響腸道菌群的細菌群落。研究組鼓勵以假設驅動的跨學科研究。

任職條件：

擁有病毒學/微生物學/微生物菌群研究背景的博士學位，技術專業(yè)領域廣泛；

擁有分子生物學、噬菌體分離或相關實驗、高通量測序技術及/或數(shù)據(jù)分析方面經驗更佳；

必須具有高度積極性、良好的團隊合作精神及職業(yè)道德，并且能夠獨立申請基金；

良好的英語溝通能力。

聯(lián)系方式： 研究員、課題組長：nicolas.berthet@ips.ac.cn/ 實驗室助理：ywtian@ips.ac.cn

申請流程:

申請書必須包含以下英文文件:

完整的簡歷, 包括博士論文, 工作經歷, 過往學術職務, 學術榮譽, 現(xiàn)任職務, 以及獲得過的資助和完整的文獻出版物清單。

目前工作內容和未來研究計劃的摘要（不超過兩頁紙）。

申請書應通過電子郵件發(fā)送至相應的PI和實驗室助理，以及emilie.carlot@ips.ac.cn和jdshen@ips.ac.cn。

擬招聘職位長期有效，直至招滿為止。